海の底に広がる大都会リーフシティ。クジラの洗鯨場“ホエール・ウォッシュ”で働くオスカーは、大きな野望を抱く小さな魚。人気者だが調子の良いオスカーはいつもトラブルばかり。彼に好意を寄せる同僚のアンジーはいつもハラハラ。一方、大ボス鮫ドン・リノの息子レニーは優しく正直。サメのくせにベジタリアンで、ドン・リノや乱暴者の兄フランキーにいつもハッパをかけられている。今日も、オスカーは“ホエール・ウォッシュ”を経営するサイクスに借金が返せず、手下のアーニー＆バーニーに深海に連れて行かれる。ひょんなことからフランキーに追いかけられるが、フランキーは大きなイカリに刺さって死んでしまう。その次第を見たアーニー＆バーニーは、オスカーがフランキーをやっつけたと勘違い。それをいいことに、オスカーは“サメ・キラーのオスカー”と名乗り始める。ビッグになるためにその名声を固めたいオスカーと、仲間の前から消えてしまいたいレニーは、一緒にある計画を考える。果たして、彼らが考えた作戦とは……？